改訂履歴
| 改定日付 | 内容 |
|---|---|
| 2024/01/23 | 「5.2.3.3. MPI並列」のMPTの例を修正 |
| 2023/10/18 | 「7.1.3. GROMACS」の例を修正 |
| 2023/08/18 | 「7.1.3. GROMACS」の例を修正 |
| 2023/07/10 | 「7.1.4. LAMMPS」の例を修正 |
| 2023/04/14 | 「7.1.5. NAMD」をNAMD 3.0b2用に修正 |
| 2023/04/06 | 「7.6.11. Singularity」にapptainerの使い方を追加 |
| 2023/03/15 | 「7.4.8. clang」にC++の場合を追加 |
| 2022/12/27 | 「7.4.6. DeePMD-kit」の例の修正 |
| 2022/12/22 | 「6. ISVアプリケーション」の修正 |
| 2022/12/16 | 「7.4.6.1.2. DeePMD-kit LAMMPS 2ノード」の追加 |
| 2022/12/13 | 「7.4.6. DeePMD-kit」の追加 |
| 2022/12/07 | 「2.2. ログイン方法」のロードバランサの記述を削除 |
| 2022/09/09 | 「7.1.4. LAMMPS」のジョブスクリプト例を修正 |
| 2022/08/23 | 「7.1.7. QUANTUM ESPRESSO」のジョブスクリプト例を修正 |
| 2022/05/31 | 「7.6.12. Alphafold」にalphafold/2.2.0の実行例を追加 |
| 2022/04/12 | 「7.1.5. NAMD」の実行例を修正 |
| 2022/04/05 | バージョンアップによる雑多な修正 |
| 2022/01/26 | 「7.6.12. Alphafold」の非商用ライセンス関係の記載を削除 |
| 2022/01/25 | 「5.2. ジョブの投入」に補足事項を追記 |
| 2021/12/13 | 「7.6.12. Alphafold」に2.1.1を追加 |
| 2021/11/12 | 「7.1.7. QUANTUM ESPRESSO」を追加 |
| 2021/11/04 | 「7.6.12 Alphaold」の例にバージョン変更方法を追記 |
| 2021/09/29 | 「2.5. TSUBAMEポイントの確認」の更新 |
| 2021/08/10 | 「7.6.12. Alphafold」にgit pullできる旨を追加 |
| 2021/08/18 | 「5.4.3. インタラクティブキュー」の利用者に関する記載を更新 |
| 2021/08/01 | 「7.6.12. Alphafold」を追加 |
| 2021/04/06 | 2021/04のメンテナンスのための各種修正 (「5.4.3. インタラクティブキュー」ほか) |
| 2021/01/20 | 「5.2.3.5. コンテナの利用」に1コンテナの場合の注意書きを追記 |
| 2020/11/17 | 「7. フリーウェア」にsingularityを追加、「7.6.11. Singularity」の実行例の修正 |
| 2020/11/17 | 「7.6.1. turbovnc」にMobaXtermでの実行例を追加、VirtualGLの例を追加 |
| 2020/11/06 | 「5.2.5. ジョブの状態確認」にRqとRrの説明を追加 |
| 2020/10/09 | 「7.6.11. Singularity」のfakerootの実行例の修正 |
| 2020/09/24 | 「5.2.3.4. プロセス並列/スレッド並列(ハイブリッド, MPI+OpenMP)」のIntel MPI/OpenMPIの例を修正 |
| 2020/08/05 | 「2.2. ログイン方法」にデフォルトの鍵ペアの場合-iオプションは省略可能な旨を追記 |
| 2020/06/01 | 「7.5.2. ParaVIew」の実行例に複数GPU版を追記 |
| 2020/05/25 | 「7.1.6. CP2K」の実行例を修正 |
| 2020/05/18 | 「7.1.4. LAMMPS」の実行例を修正 |
| 2020/04/30 | 「5.4.1. インタラクティブノードを利用したX転送」を修正 |
| 2020/04/22 | 「5.3. 計算ノードの予約」にt3-user-info compute arsを追記 |
| 2020/04/22 | 「4.6.5. GPUDirect RDMA」でopenmpi/2.1.2-opa10.9-t3をopenmpi/3.1.4-opa10.10-t3に変更 |
| 2020/04/09 | 「5.2.4.1. お試し実行」に https://www.t3.gsic.titech.ac.jp/node/129 をマージ |
| 2020/04/08 | 「5.2.8. アレイジョブ」にタスク数をなるべく減らす旨を追記 |
| 2020/04/07 | 「5.1.1.1. 利用可能な資源タイプ」のf_nodeのメモリ使用量を変更 |
| 2020/02/28 | 「4.4. PGIコンパイラ」を追加 |
| 2020/02/05 | 「5.2.2. ジョブスクリプト」にshebangについての注意を追記 |
| 2020/01/17 | 「5.5. 計算ノードへのSSHログイン」に計算ノードへsshした際にプロセスを見る方法を追記 |
| 2019/12/16 | 「7.2.1. OpenFOAM」にFoundation版とESI版の2種類があることを記載 |
| 2019/12/06 | 「5.4.3. インタラクティブキュー」を修正 |
| 2019/12/03 | 「7.6.1.1. turbovnc + VirtualGL」を追加 |
| 2019/11/29 | 「7.4.7. clang」を追加 |
| 2019/11/29 | 「7.6.1. turbovnc」を追加 |
| 2019/11/12 | 「5.4.3. インタラクティブキュー」を追加 |
| 2019/10/21 | 「7.6.10. Singularity」のfakerootオプションの例を修正 |
| 2019/10/04 | 「7.6.10. Singularity」にfakerootオプションの例を追加 |
| 2019/09/27 | 「5.3. 計算ノードの予約」のリンクの修正 |
| 2019/08/02 | 「5. ジョブスケジューリングシステム」の章番号の見直し |
| 2019/07/31 | 「5.2.3.1. シングルジョブ」の例をf_nodeからs_coreに変更 |
| 2019/07/30 | PGIコンパイラ利用の手引きから「GPU用数値計算ライブラリ」を7.3.に移行 |
| 2019/07/17 | 「5.4. チェックポイント」を削除、「7.5.9. DMTCP」を追加 |
| 2019/07/10 | 「5.3. インタラクティブジョブの投入」ジョブ終了方法の記載を修正 |
| 2019/06/12 | 「5.8.5. ネットワーク系アプリケーションへの接続」を追加 |
| 2019/06/10 | 「4.5.3 CUDA対応のMPI」、「4.5.5 GPUDirect RDMA」の例をOPA10.9用に修正 |
| 2019/06/07 | 「5.2.2 ジョブスクリプト」の各セクションの説明を追加 |
| 2019/05/31 | 「2.2.1. ログインノードにおける高負荷プログラムの実行制限について」を記載 |
| 2019/05/30 | ドキュメントシステムの変更 表現の微修正 |
| 2019/05/20 | 「5.5 予約実行」の実行制限について記述を修正 |
| 2019/05/15 | 「7.1.4 LAMMPS」、「7.1.5 NAMD」のリンクを修正 |
| 2019/03/29 | 「5.8 コンテナジョブ」の追加 「5.6.1 ローカルスクラッチ領域」に$T3TMPDIRを追記 |
| 2019/01/25 | 章番号変更に伴う参照の修正 |
| 2019/01/25 | 「4.2.5 ジョブスクリプトの記述例MPI並列」「4.2.5 ジョブスクリプトの記述例プロセス並列/スレッド並列(ハイブリッド) 」のOpenMPI項にライブラリの環境変数を加筆 |
| 2019/01/17 | 章の名称・順番・カテゴリーの変更 |
| 2019/01/16 | 「表4.3 qsubコマンドの主なオプション」の-mオプションに注意事項を追記 「4.6.1.Homeディレクトリ」にクオータ制限の注意事項を追記 |
| 2018/12/03 | 「3.5.6.GPUのCOMPUTE MODEの変更」を追記 「4.6.4.共有スクラッチ領域」を加筆 |
| 2018/10/26 | 「4.1. 利用可能な資源タイプ」の制限値についての記述を修正 |
| 2018/09/19 | 「5. ISVアプリケーション」を2018年9月時点の環境に合うように修正 |
| 2018/09/06 | 「6.5.9 singularity」を追加 |
| 2018/08/23 | 「6.3 Caffe,Chainer,Tensorflow」の利用手順を修正 |
| 2018/07/27 | 「5.8 Gaussian」「5.9 GaussView」の利用手順を修正 |
| 2018/05/25 | 「2.5 TSUBAMEポイントの確認」を追記 「4.6.1 Homeディレクトリ」,「4.6.2 高速ストレージ」の容量確認方法を加筆 |
| 2018/05/09 | 「3.1.1利用可能なmodule環境の表示」からモジュール一覧を削除、webページへのリンクを追加 |
| 2018/02/07 | 「2.4 ログインシェルの変更」を追記 「4.2.2 ジョブスクリプト」の優先度オプションを加筆 |
| 2018/01/13 | 「4.5 予約実行」を追記 |
| 2018/01/12 | 「2.2ログイン方法」を加筆 「4.3.1.インタラクティブノードを利用したX転送」を加筆 |
| 2017/12/28 | 「4.2ジョブ投入」にアレイジョブの項目を加筆 「4.4 シグナル通知/チェックポイント」を追記 「4.5 ストレージの利用」を加筆 |
| 2017/12/18 | 「3.1.1.利用可能なmodule環境の表示」を追記 「3.5 GPU環境」を加筆 |
| 2017/10/26 | 「5.12.4 ユーザー認証について」を削除 |
| 2017/10/05 | 「6.3.3.Caffe」にMKLの利用方法について追記 |
| 2017/09/25 | 「4.3.1.インタラクティブノードを利用したX転送」を追記 |
| 2017/09/14 | 「2.4ストレージサービス(CIFS)」にCIFSボリューム表示を加筆 |
| 2017/09/11 | 「2.2ログイン方法」にログインノードの制限を加筆 「2.4ストレージサービス(CIFS)」にCIFSボリューム表示を加筆 「4.4.4共有スクラッチ領域」のアクセス方法の追記 |
| 2017/09/06 | 改定第3版 |
| 2017/08/17 | 改定第2版 |
| 2017/07/31 | 初版 |