サポートされているアプリケーション

(2023.1.20現在)

ISVアプリケーション

学外利用者などは利用できるアプリケーションに制限があります。詳しくはこちらをご覧ください。利用可能なモジュールファイルについてはTSUBAME上で$module av コマンドにてご確認下さい。(モジュールファイルの太字がデフォルト)

一部のアプリケーションについて実行時の制限を設けております。

アプリケーション名概要GPU対応バージョン/モジュールファイルライセンス数備考
開発環境、ライブラリ
Intel Compiler(Intel Parallel Studio XE Cluster Edition)Intel 開発環境 
2016update4intel/16.0.4.258
2017update4intel/17.0.4.196
2017update5intel/17.0.5.239
2018update1intel/18.0.1.163
2019update0intel/19.0.0.117
2020update0intel/19.1.0.166
2020update1intel/19.1.1.217
2020update4intel/19.1.3.304
2021.1intel/21.1.1
2021.2intel/21.2.0
2021.5intel/21.5.0
2023.0intel/23.0.0
52021.1からはintel oneAPI
PGI CompilerPGIコンパイラ
17.5pgi/17.5
17.10pgi/17.10
18.1pgi/18.1
18.7pgi/18.7
19.1pgi/19.1
19.7pgi/19.7
20.1pgi/20.1
5

PGIコンパイラにはLLVM版とno LLVM版があります。

LLVM版を使うには$ module load pgi/xxx, no LLVM版を使うには$ module load pgi-nollvm pgi/xxxとして下さい。

NVIDIA HPC SDKPGIコンパイラの後継
20.9nvhpc/20.9
21.2nvhpc/21.2
21.7nvhpc/21.7
22.2nvhpc/22.2
23.1nvhpc/23.1
23.7nvhpc/23.7
  
Arm Forge (旧 Allinea Forge)統合開発環境(デバッグ、プロファイル、最適化、コーディング、ビルド)
7.0.5forge/7.0.5
allinea/7.0.5
18.0.1forge/18.0.1
19.0.5forge/19.0.5
20.0.3forge/20.0.3
21.0.0forge/21.0.0
21.1.3forge/21.1.3
22.1.3forge/22.1.3
同時使用32
1解析あたり64並列まで
 
CUDACUDA コンパイラ
8.0.44cuda/8.0.44
8.0.61cuda/8.0.61
9.0.176cuda/9.0.176
9.1.85cuda/9.1.85
9.2.148cuda/9.2.148
10.0.130cuda/10.0.130
10.1.105cuda/10.1.105
10.2.89cuda/10.2.89
11.0.194cuda/11.0.194
11.0.3cuda/11.0.3
11.2.146cuda/11.2.146
11.5.0cuda/11.5.0
11.6.1cuda/11.6.1
11.6.2cuda/11.6.2
12.1.0cuda/12.1.0
 (※)cuda/11.2以降はCUDA11.0.3相当のドライバでCUDA Commpatibility Platformを用いて動作しています。
CuDNNNVIDIA CUDA® Deep Neural Network library (CuDNN)
5.1cudnn/5.1
6.0cudnn/6.0
7.0cudnn/7.0
7.1cudnn/7.1
7.4cudnn/7.4
7.6cudnn/7.6
8.1cudnn/8.1
8.3cudnn/8.3
8.8.1cudnn/8.8.1
  
NCCLNVIDIA Collective Communications Library (NCCL)
1.3.4nccl/1.3.4
2.1nccl/2.1
2.2.13nccl/2.2.13
2.4.2nccl/2.4.2
2.8.4nccl/2.8.4
2.12.7nccl/2.12.7
2.17.1nccl/2.17.1
  
intel MPIintel MPI library 
17.3.196intel-mpi/17.3.196
17.4.239intel-mpi/17.4.239
18.1.163intel-mpi/18.1.163
19.0.117intel-mpi/19.0.117
19.6.166intel-mpi/19.6.166
19.7.217intel-mpi/19.7.217
19.9.304intel-mpi/19.9.304
21.1.1intel-mpi/21.1.1
21.2.0intel-mpi/21.2.0
21.5.1intel-mpi/21.5.1
21.8.0intel-mpi/21.8.0
 21.1.1からはintel oneAPI
mptsgi mpt MPI library 
2.16mpt/2.16
  
数値解析/可視化ソフトウェア
Mathematica数式処理システム11.2:○
11.1.1mathematica/11.1.1
11.2mathematica/11.2.0
11.3.0mathematica/11.3.0
12.0.0mathematica/12.0.0
12.1.0mathematica/12.1.0
12.1.1mathematica/12.1.1
12.2.0mathematica/12.2.0
13.1.0mathematica/13.1.0
13.2.1mathematica/13.2.1
13.3.0mathematica/13.3.0
13.3.1mathematica/13.3.1
無制限 
Maple数式処理システム
2019.1maple/2019.1
2019.2.1maple/2019.2.1
2020.1maple/2020.1
2021.1maple/2021.1
1 
MATLAB行列計算、ベクトル演算、グラフ化や3次元表示などのライブラリを持つインタプリタ形式の数値解析ソフトウェア
R2017amatlab/R2017a
R2017bmatlab/R2017b
R2018amatlab/R2018a
R2018bmatlab/R2018b
R2017a u3matlab/R2017a_u3
R2017b u9matlab/R2017b_u9
R2018a u6matlab/R2018a_u6
R2019amatlab/R2019a
R2019bmatlab/R2019b
R2020amatlab/R2020a
R2020bmatlab/R2020b
R2021amatlab/R2021a
R2021bmatlab/R2021b
R2022amatlab/R2022a
R2022bmatlab/R2022b
R2023amatlab/R2023a
R2023bmatlab/R2023b
無制限 
AVS/Express汎用可視化ソフトウェア 
8.4avs/8.4
8.5avs/8.5
20 
AVS/Express PCEクラスター対応並列可視化ソフトウェア、AVS/Express の Parallel Cluster Edition (PCE) 
8.4avs/8.4
1 
シミュレーション ソフトウェア
ANSYS有限要素法CAEを中心とする解析ソフトウェア群Fluent:○
18.1ansys/R18.1
18.2ansys/R18.2
19.0ansys/R19.0
19.3ansys/R19.3
19.4ansys/R19.4
19.5ansys/R19.5
20.1ansys/R20.1
20.2ansys/R20.2
21.1ansys/R21.1
22.1ansys/R22.1
22.2ansys/R22.2
23.1ansys/R23.1
23.2ansys/R23.2
50 token(Mechanical$CFD, Electronics Suite)
256 token(HPC)
元々はFluentのみでしたが、Mechanicalが追加され、T3では電磁界解析パッケージも含まれます。
CFD/Mechanical/HFSS/EMの各パッケージに付き50token/256token利用可能です。
2021 R1の機能表
2022 R1の機能表
2023 R1の機能表
Academic Research Multiphysics Campus Solutionの機能を確認してください。
表がリンク切れの場合はこちらをご覧ください。
ABAQUS有限要素解析ソフトウェア
2017abaqus/2017
2020abaqus/2020
2021abaqus/2021
2022abaqus/2022
2023abaqus/2023
500 token
(1ユーザ140tokenまで)
 
ABAQUS CAEABAQUS専用のプリ・ポストツール 
2017abaqus/2017
2020abaqus/2020
2021abaqus/2021
2022abaqus/2022
10 token 
MSC One有限要素法を中心とする解析ソフトウェア群Nastran:○
2017dytran/2017
marc_mentat/2017
marc_mentat/2017.1
nastran/2017.1
patran/2017.0.2
2018

dytran/2018

marc_mentat/2018.1
nastran/2018.1
nastran/2018.2
nastran/2018.2.1
patran/2018.0

2019

marc_mentat/2019

marc_mentat/2019.1

nastran/2019.0

patran/2019.0

patran/2019fp1

2020

marc_mentat/2020

marc_mentat/2020.1

nastran/2020.0

patran/2020.0

2021

marc_mentat/2020.1

marc_mentat/2021.1

marc_mentat/2021.2

marc_mentat/2021.4

nastran/2021.0

nastran/2021.1

nastran/2021.2

nastran/2021.4

patran/2021.0

patran/2021.1

patran/2021.2

patran/2021.4

dytran/2021

dytran/2021.1

dytran/2021.2

2022

marc_mentat/2022.1

marc_mentat/2022.3

marc_mentat/2022.4

nastran/2022.1

nastran/2022.3

nastran/2022.4

patran/2022.1

patran/2022.3

patran/2022.4

dytran/2022.1

dytran/2022.2

2023

marc_mentat/2023.1

marc_mentat/2023.2

marc_mentat/2023.3

marc_mentat/2023.4

nastran/2023.1

nastran/2023.2

nastran/2023.3

nastran/2023.4

patran/2023.1

patran/2023.2

patran/2023.3

patran/2023.4

dytran/2023.1

dytran/2023.2

770 token
Nastran, Patran, Apex, Dytran, Marc/Mentatを含む。
 
Gaussian分子軌道法プログラム16 B.01:○
16 A.03gaussian16/A03
16 B.01gaussian16/B01
16 B.01gaussian16/B01_gpu
16 C.01gaussian16/C01_cpu
16 C.01gaussian16/C01_gpu
無制限16 B.01はGPU (P100) 及びLindaに対応
*ログインノードでは実行できません
Gauss ViewGaussian専用のプリ・ポストツール 
6gaussview/6
無制限 
AMBER分子動力学プログラム
16amber/16
16cudaamber/16_cuda
16up10amber/16up10
16up10cudaamber/16up10_cuda
16up12cudaamber/16up12_cuda
18up5amber/18up5
18up12amber/18up12
20up0amber/20up0
20up08amber/20up08
22up0amber/22up0
22up0amber/22up0_at22up3
22up04amber/22up04_at23up03
無制限
18以降はcuda対応
 
Materials Studio材料科学向けモデリング/シミュレーション環境 

2017 R2

2018

2020

2021

2022

2023

20 token 
Discovery Studioライフサイエンス向けモデリング/シミュレーション環境 

2017 R2

2018

2020

2021

2022

20 token 
LS-DYNA汎用非線形構造解析ソフトウェア 
R9.1.0lsdyna/R9.1.0
R9.3.1lsdyna/R9.3.1
R10.1.0lsdyna/R10.1.0
R10.2.0lsdyna/R10.2.0
R11.1.0lsdyna/R11.1.0
16 
      
COMSOL Multiphysics有限要素法(FEM)ベースの汎用工学シミュレーションソフトウェア 
5.3.0.260comsol/53
5.3.1.180comsol/53a
5.3.1.201comsol/53a_u1
5.3.1.229comsol/53a_u2
5.3.1.275comsol/53a_u3
5.3.1.348comsol/53a_u4
5.4.0.225comsol/54
5.4.0.246comsol/54_u1
5.4.0.346comsol/54_u3
5.4.0.388comsol/54_u4
5.5.0.292comsol/55
5.5.0.306comsol/55_u1
5.5.0.352comsol/55_u2
5.5.0.359comsol/55_u3
5.6.0.280comsol/56
5.6.0.341comsol/56_u1
5.6.0.401comsol/56_u2
6.0.0.318comsol/60_u0
6.0.0.354comsol/60_u1
6.0.0.405comsol/60_u2
6.1.0.252comsol/61
6.1.0.346comsol/61_u2
6.2.0.278comsol/62
2
以下の各モジュールを含む(AC/DC, RF, 波動光学, プラズマ, 伝熱, 構造力学, CFD, CADインポート)
 
Schrodinger Small-Molecule Drug Discovery Suite低分子創薬向けモデリング/シミュレーションソフトウェア群 
2017-2schrodinger/Feb-17
2020-2schrodinger/2020-2
2021-1schrodinger/2021-1
2現行システムのOSであるSLES12 SP4に対応したバージョンは2020-2までとなります。

フリーソフトウェア

アプリケーション名バージョン/モジュールファイル概要備考
機械学習、Deep Learningフレームワーク
Caffe
1.0caffe/1.0
Berkeley AI Research (BAIR) が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python, C++ に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。

Chainer
4.3.0chainer/4.3.0
5.2.0chainer/5.2.0
Preferred Networks が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。

TensorFlow
1.9.0tensorflow/1.9.0
1.12.0tensorflow/1.12.0
2.4.1tensorflow/2.4.1
2.8.0tensorflow/2.8.0
Google が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python, C++ に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。

Alphafold
2.0.0alphafold/2.0.0
2.1.1alphafold/2.1.1
2.2.0alphafold/2.2.0
2.3.0alphafold/2.3.0
DeepMindが開発している機械学習を利用したたんぱく質構造予測プログラム公式サイト
開発環境、ライブラリ、ツール
OpenMPI
2.1.2-opa10.9openmpi/2.1.2-opa10.9
2.1.2-opa10.9-t3openmpi/2.1.2-opa10.9-t3
2.1.2-opa10.9-thread-multipleopenmpi/2.1.2-opa10.9-thread-multiple
3.1.4-opa10.10openmpi/3.1.4-opa10.10
3.1.4-opa10.10-t3openmpi/3.1.4-opa10.10-t3
4.0.7openmpi/4.0.7
4.0.7-t3openmpi/4.0.7-t3
OpenMPI MPI library

GPU Direct使用時には-t3モジュールをご使用下さい。

2.1.2-opa10.9*または3.1.4-opa10.10*はOmni-Pathバンドル版のOpenMPIです。

Apache Hadoop
2.8.0hadoop/2.8.0
大規模データの分散処理ミドルウェア 
openjdk
1.8.0.242openjdk/1.8.0.242
Java開発環境 
PETSc
3.7.6 realpetsc/3.7.6/real
3.7.6 complexpetsc/3.7.6/complex
3.9.3 realpetsc/3.9.3/real
3.9.3 complexpetsc/3.9.3/complex
3.14.5 realpetsc/3.14.5/real
3.14.5 complexpetsc/3.14.5/complex
科学技術計算向けライブラリ群 
fftw
2.1.5fftw/2.1.5
3.3.6fftw/3.3.6
3.3.8fftw/3.3.8
3.3.9fftw/3.3.9
3.3.10fftw/3.3.10
離散フーリエ変換 (DFT) ライブラリ 
Performance API (PAPI) ライブラリ
5.5.1papi/5.5.1
CPUやGPUのHardware counter解析用APIライブラリ 
python
3.6.5python/3.6.5
3.8.3python/3.8.3
3.9.2python/3.9.2
3.10.2python/3.10.2
3.11.2python/3.11.2
python開発環境 
gcc
8.3.0

gcc/8.3.0

gcc/8.3.0-cuda

10.1.0

gcc/10.1.0

gcc/10.1.0-cuda

10.2.0

gcc/10.2.0

gcc/10.2.0-cuda

11.2.0

gcc/11.2.0

gcc/11.2.0-cuda

12.2.0

gcc/12.2.0

gcc/12.2.0-cuda

GNU Compiler Collection 
vim
8.1vim/8.1
テキストエディタ 
emacs
28.2emacs/28.2
テキストエディタ 
ninja
1.10.0ninja/1.10.0
ビルドツール 
HDF5
1.10.1hdf5/1.10.1
1.10.5hdf5-parallel/1.10.5
1.12.0hdf5-parallel/1.12.0
I/Oライブラリ 
NetCDF
4.7.0netcdf-parallel/4.7.0
4.7.4netcdf-parallel/4.7.4
I/Oライブラリ 
数値解析/可視化ソフトウェア、ツール
ParaView
5.0.1paraview/5.0.1
5.4.0paraview/5.4.0
5.8.0

paraview/5.8.0

paraview/5.8.0-egl

5.9.0

paraview/5.9.0

paraview/5.9.0-egl

5.10.0

paraview/5.10.0

paraview/5.10.0-egl

5.11.0

paraview/5.11.0

paraview/5.11.0-egl

大規模データ分析、可視化アプリケーション並列版ParaView
POV-Ray
3.7.0.3pov-ray/3.7.0.3
可視化アプリケーション 
VisIt
2.12.3visit/2.12.3
大規模データ分析、可視化アプリケーション 
R
3.4.1r/3.4.1
統計解析システム 
GIMP
2.8.22gimp/2.8.22
2.10.4gimp/2.10.4
画像処理ソフト(ペイントソフト) 
gnuplot
5.0.6gnuplot/5.0.6
5.2.4gnuplot/5.2.4
5.4.1gnuplot/5.4.1
5.4.3gnuplot/5.4.3
グラフ作成ソフト 
tgif
4.2.5tgif/4.2.5
2次元の描画ソフト 
ImageMagick
7.0.6imagemagick/7.0.6
7.0.11-1imagemagick/7.0.11-1
画像表示と画像処理ソフト 
vmd
1.9.3vmd/1.9.3
MD用可視化ソフト 
turbovnc
2.2.2turbovnc/2.2.2
VNCサーバソフト 
VirtualGL
2.6.2turbovnc/2.2.2
リモートレンダリングソフト 
ffmpeg
4.2.2ffmpeg/4.2.2
オーディオ・ビデオコンバーター 
シミュレーション ソフトウェア
GAMESS
apr202017r1gamess/apr202017r1
分子軌道法プログラム 
CP2K
4.1cp2k/4.1
4.1-libintcp2k/4.1-libint
5.1_cudacp2k/5.1_cuda
5.1-libintcp2k/5.1-libint
7.1.0cp2k/7.1.0
8.1.0cp2k/8.1.0
9.1.0cp2k/9.1.0
電子状態計算プログラム 
QUANTUM ESPRESSO
6.8quantumespresso/6.8
7.1quantumespresso/7.1
分子動力学プログラム 
DeePMD-kit
2.1.5deepmd-kit/2.1.5
分子動力学プログラム+機械学習 
GROMACS
4.6.7gromacs/4.6.7
2016.3gromacs/2016.3
2018.1gromacs/2018.1
2019.4gromacs/2019.4
2020.2gromacs-deepmd/2020.2
2020.4gromacs/2020.4
2021.3gromacs/2021.3
2022gromacs/2022
2023gromacs/2023
master-20230413gromacs/master-20230413
分子動力学プログラム

gromacs/2019.4, gromacs/2020.4はPLUMEDがenable

gromacs-deepmd/2020.2はDeepMD-kitがenable

LAMMPS
31mar2017lammps/31mar2017
3mar2020lammps/3mar2020
9Oct2020lammps/9oct2020
10feb2021lammps/10feb2021
29sep2021_u2lammps/29sep2021_u2
23jun2022_u1lammps/23jun2022_u1
23jun2022_u2lammps/23jun2022_u2
23jun2022_u3lammps/23jun2022_u3
分子動力学プログラムlammps/23jun2022_u2はDeePMD-kitと連携可能
NAMD
2.12namd/2.12
2.12-20180711namd/2.12-20180711
2.13namd/2.13
2.13-20191210namd/2.13-20191210
2.14b1namd/2.14b1
2.14b2namd/2.14b2
2.14namd/2.14
2.15alpha1namd/2.15alpha1
20220414namd/20220414
3.0b2namd/3.0b2
分子動力学プログラム 
Tinker
8.1.2tinker/8.1.2
8.7.2tinker/8.7.2
8.8.3tinker/8.8.3
8.10.1tinker/8.10.1
8.10.5tinker/8.10.5
分子動力学プログラム 
OpenFOAM
4.1openfoam/4.1
6.0openfoam/6.0
7.0openfoam/7.0
8.0openfoam/8.0
9.0openfoam/9.0
10.0openfoam/10.0
流体/連続体シミュレーション 
ESI OpenFOAM
v1906openfoam-esi/v1906
v1912openfoam-esi/v1912
v2012openfoam-esi/v2012
v2112openfoam-esi/v2112
v2212openfoam-esi/v2212
流体/連続体シミュレーション 
linux container
Singularity
3.6.3singularity/3.6.3
3.6.4singularity/3.6.4
3.7.1singularity/3.7.1
3.8.6singularity/3.8.6
3.8.7singularity/3.8.7
linux container for HPC 
apptainer
1.1.6apptainer/1.1.6
linux container for HPC