サポートされているアプリケーション

(2023.1.20現在)

ISVアプリケーション

学外利用者などは利用できるアプリケーションに制限があります。詳しくはこちらをご覧ください。利用可能なモジュールファイルについてはTSUBAME上で$module av コマンドにてご確認下さい。(モジュールファイルの太字がデフォルト)

一部のアプリケーションについて実行時の制限を設けております。

アプリケーション名 概要 GPU対応 バージョン/モジュールファイル ライセンス数 備考
開発環境、ライブラリ
Intel Compiler(Intel Parallel Studio XE Cluster Edition) Intel 開発環境  
2016update4 intel/16.0.4.258
2017update4 intel/17.0.4.196
2017update5 intel/17.0.5.239
2018update1 intel/18.0.1.163
2019update0 intel/19.0.0.117
2020update0 intel/19.1.0.166
2020update1 intel/19.1.1.217
2020update4 intel/19.1.3.304
2021.1 intel/21.1.1
2021.2 intel/21.2.0
2021.5 intel/21.5.0
2023.0 intel/23.0.0
5 2021.1からはintel oneAPI
PGI Compiler PGIコンパイラ ○
17.5 pgi/17.5
17.10 pgi/17.10
18.1 pgi/18.1
18.7 pgi/18.7
19.1 pgi/19.1
19.7 pgi/19.7
20.1 pgi/20.1
5

PGIコンパイラにはLLVM版とno LLVM版があります。

LLVM版を使うには$ module load pgi/xxx, no LLVM版を使うには$ module load pgi-nollvm pgi/xxxとして下さい。
NVIDIA HPC SDK PGIコンパイラの後継 〇
20.9 nvhpc/20.9
21.2 nvhpc/21.2
21.7 nvhpc/21.7
22.2 nvhpc/22.2
   
Arm Forge (旧 Allinea Forge) 統合開発環境（デバッグ、プロファイル、最適化、コーディング、ビルド） 〇
7.0.5 forge/7.0.5
allinea/7.0.5
18.0.1 forge/18.0.1
19.0.5 forge/19.0.5
20.0.3 forge/20.0.3
21.0.0 forge/21.0.0
21.1.3 forge/21.1.3
同時使用32
1解析あたり64並列まで		  
CUDA CUDA コンパイラ 〇
8.0.44 cuda/8.0.44
8.0.61 cuda/8.0.61
9.0.176 cuda/9.0.176
9.1.85 cuda/9.1.85
9.2.148 cuda/9.2.148
10.0.130 cuda/10.0.130
10.1.105 cuda/10.1.105
10.2.89 cuda/10.2.89
11.0.194 cuda/11.0.194
11.0.3 cuda/11.0.3
11.2.146 cuda/11.2.146
11.5.0 cuda/11.5.0
  (※)cuda/11.2以降はCUDA11.0.3相当のドライバでCUDA Commpatibility Platformを用いて動作しています。
CuDNN NVIDIA CUDA® Deep Neural Network library (CuDNN) ○
5.1 cudnn/5.1
6.0 cudnn/6.0
7.0 cudnn/7.0
7.1 cudnn/7.1
7.4 cudnn/7.4
7.6 cudnn/7.6
8.1 cudnn/8.1
8.3 cudnn/8.3
   
NCCL NVIDIA Collective Communications Library (NCCL) ○
1.3.4 nccl/1.3.4
2.1 nccl/2.1
2.2.13 nccl/2.2.13
2.4.2 nccl/2.4.2
2.8.4 nccl/2.8.4
2.12.7 nccl/2.12.7
   
intel MPI intel MPI library  
17.3.196 intel-mpi/17.3.196
17.4.239 intel-mpi/17.4.239
18.1.163 intel-mpi/18.1.163
19.0.117 intel-mpi/19.0.117
19.6.166 intel-mpi/19.6.166
19.7.217 intel-mpi/19.7.217
19.9.304 intel-mpi/19.9.304
21.1.1 intel-mpi/21.1.1
21.2.0 intel-mpi/21.2.0
21.5.1 intel-mpi/21.5.1
21.8.0 intel-mpi/21.8.0
  21.1.1からはintel oneAPI
mpt sgi mpt MPI library  
2.16 mpt/2.16
   
数値解析/可視化ソフトウェア
Mathematica 数式処理システム 11.2:○
11.1.1 mathematica/11.1.1
11.2 mathematica/11.2.0
11.3.0 mathematica/11.3.0
12.0.0 mathematica/12.0.0
12.1.0 mathematica/12.1.0
12.1.1 mathematica/12.1.1
12.2.0 mathematica/12.2.0
13.1.0 mathematica/13.1.0
13.2.1 mathematica/13.2.1
無制限  
Maple 数式処理システム ○
2019.1 maple/2019.1
2019.2.1 maple/2019.2.1
2020.1 maple/2020.1
2021.1 maple/2021.1
1  
MATLAB 行列計算、ベクトル演算、グラフ化や3次元表示などのライブラリを持つインタプリタ形式の数値解析ソフトウェア ○
R2017a matlab/R2017a
R2017b matlab/R2017b
R2018a matlab/R2018a
R2018b matlab/R2018b
R2017a u3 matlab/R2017a_u3
R2017b u9 matlab/R2017b_u9
R2018a u6 matlab/R2018a_u6
R2019a matlab/R2019a
R2019b matlab/R2019b
R2020a matlab/R2020a
R2020b matlab/R2020b
R2021a matlab/R2021a
R2021b matlab/R2021b
R2022a matlab/R2022a
R2022b matlab/R2022b
無制限  
AVS/Express 汎用可視化ソフトウェア  
8.4 avs/8.4
8.5 avs/8.5
20  
AVS/Express PCE クラスター対応並列可視化ソフトウェア、AVS/Express の Parallel Cluster Edition (PCE)  
8.4 avs/8.4
1  
シミュレーション ソフトウェア
ANSYS 有限要素法CAEを中心とする解析ソフトウェア群 Fluent:○  
18.1 ansys/R18.1
18.2 ansys/R18.2
19.0 ansys/R19.0
19.3 ansys/R19.3
19.4 ansys/R19.4
19.5 ansys/R19.5
20.1 ansys/R20.1
20.2 ansys/R20.2
21.1 ansys/R21.1
22.1 ansys/R22.1
22.2 ansys/R22.2
50 token(Mechanical$CFD, Electronics Suite)
256 token(HPC)		 元々はFluentのみでしたが、Mechanicalが追加され、T3では電磁界解析パッケージも含まれます。
CFD/Mechanical/HFSS/EMの各パッケージに付き50token/256token利用可能です。
2021 R1の機能表
2022 R1の機能表
Academic Research Multiphysics Campus Solutionの機能を確認してください。
表がリンク切れの場合はこちらをご覧ください。
ABAQUS 有限要素解析ソフトウェア ○
2017

abaqus/2017
2020 abaqus/2020
2021 abaqus/2021
2022 abaqus/2022
500 token
(1ユーザ140tokenまで)		  
ABAQUS CAE ABAQUS専用のプリ・ポストツール  
2017 abaqus/2017
2020 abaqus/2020
2021 abaqus/2021
2022 abaqus/2022
10 token  
MSC One 有限要素法を中心とする解析ソフトウェア群 Nastran:○
2017

dytran/2017
marc_mentat/2017
marc_mentat/2017.1
nastran/2017.1
patran/2017.0.2
2018

dytran/2018

marc_mentat/2018.1
nastran/2018.1
nastran/2018.2
nastran/2018.2.1
patran/2018.0
2019

marc_mentat/2019

marc_mentat/2019.1

nastran/2019.0

patran/2019.0

patran/2019fp1
2020

marc_mentat/2020

marc_mentat/2020.1

nastran/2020.0

patran/2020.0
2021

marc_mentat/2020.1

marc_mentat/2021.1

marc_mentat/2021.2

marc_mentat/2021.4

nastran/2021.0

nastran/2021.1

nastran/2021.2

nastran/2021.4

patran/2021.0

patran/2021.1

patran/2021.2

patran/2021.4

dytran/2021

dytran/2021.1

dytran/2021.2
2022

marc_mentat/2022.1

marc_mentat/2022.3

marc_mentat/2022.4

nastran/2022.1

nastran/2022.3

nastran/2022.4

patran/2022.1

patran/2022.3

patran/2022.4

dytran/2022.1

dytran/2022.2

770 token
Nastran, Patran, Apex, Dytran, Marc/Mentatを含む。

  
Gaussian 分子軌道法プログラム 16 B.01:○
16 A.03 gaussian16/A03
16 B.01 gaussian16/B01
16 B.01 gaussian16/B01_gpu
16 C.01 gaussian16/C01_cpu
16 C.01 gaussian16/C01_gpu
無制限 16 B.01はGPU (P100) 及びLindaに対応
*ログインノードでは実行できません
Gauss View Gaussian専用のプリ・ポストツール  
6 gaussview/6
無制限  
AMBER 分子動力学プログラム ○
16 amber/16
16cuda amber/16_cuda
16up10 amber/16up10
16up10cuda amber/16up10_cuda
16up12cuda amber/16up12_cuda
18up5 amber/18up5
18up12 amber/18up12
20up0 amber/20up0
20up08 amber/20up08
22up0 amber/22up0
無制限
18以降はcuda対応		  
Materials Studio 材料科学向けモデリング/シミュレーション環境  

2017 R2

2018

2020

2021

2022

 20 token  
Discovery Studio ライフサイエンス向けモデリング/シミュレーション環境  

2017 R2

2018

2020

2021

2022

 20 token  
LS-DYNA 汎用非線形構造解析ソフトウェア  
R9.1.0 lsdyna/R9.1.0
R9.3.1 lsdyna/R9.3.1
R10.1.0 lsdyna/R10.1.0
R10.2.0 lsdyna/R10.2.0
R11.1.0 lsdyna/R11.1.0
16  
           
COMSOL Multiphysics 有限要素法(FEM)ベースの汎用工学シミュレーションソフトウェア  
5.3.0.260 comsol/53
5.3.1.180 comsol/53a
5.3.1.201 comsol/53a_u1
5.3.1.229 comsol/53a_u2
5.3.1.275 comsol/53a_u3
5.3.1.348 comsol/53a_u4
5.4.0.225 comsol/54
5.4.0.246 comsol/54_u1
5.4.0.346 comsol/54_u3
5.4.0.388 comsol/54_u4
5.5.0.292 comsol/55
5.5.0.306 comsol/55_u1
5.5.0.352 comsol/55_u2
5.5.0.359 comsol/55_u3
5.6.0.280 comsol/56
5.6.0.341 comsol/56_u1
5.6.0.401 comsol/56_u2
6.0.0.318 comsol/60_u0
6.0.0.354 comsol/60_u1
6.0.0.405 comsol/60_u2
6.1.0.252 comsol/61
2
以下の各モジュールを含む(AC/DC, RF, 波動光学, プラズマ, 伝熱, 構造力学, CFD, CADインポート)		  
Schrodinger Small-Molecule Drug Discovery Suite 低分子創薬向けモデリング/シミュレーションソフトウェア群  
2017-2 schrodinger/Feb-17
2020-2 schrodinger/2020-2
2021-1 schrodinger/2021-1
2 現行システムのOSであるSLES12 SP4に対応したバージョンは2020-2までとなります。

フリーソフトウェア

アプリケーション名 バージョン/モジュールファイル 概要 備考
機械学習、Deep Learningフレームワーク
Caffe
1.0 caffe/1.0
Berkeley AI Research (BAIR) が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python, C++ に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。
Chainer
4.3.0 chainer/4.3.0
5.2.0 chainer/5.2.0
Preferred Networks が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。
TensorFlow
1.9.0 tensorflow/1.9.0
1.12.0 tensorflow/1.12.0
2.4.1 tensorflow/2.4.1
2.8.0 tensorflow/2.8.0
Google が開発しているDeep Learning フレームワーク。Python, C++ に対応。

公式サイト

最新版をご自身の環境にインストールしたい場合はこちらをご参照下さい。
Alphafold
2.0.0 alphafold/2.0.0
2.1.1 alphafold/2.1.1
2.2.0 alphafold/2.2.0
2.3.0 alphafold/2.3.0
DeepMindが開発している機械学習を利用したたんぱく質構造予測プログラム

公式サイト
開発環境、ライブラリ、ツール
OpenMPI
2.1.2-opa10.9 openmpi/2.1.2-opa10.9
2.1.2-opa10.9-t3 openmpi/2.1.2-opa10.9-t3
2.1.2-opa10.9-thread-multiple openmpi/2.1.2-opa10.9-thread-multiple
3.1.4-opa10.10 openmpi/3.1.4-opa10.10
3.1.4-opa10.10-t3 openmpi/3.1.4-opa10.10-t3
4.0.7 openmpi/4.0.7
4.0.7-t3 openmpi/4.0.7-t3
OpenMPI MPI library

GPU Direct使用時には-t3モジュールをご使用下さい。

2.1.2-opa10.9*または3.1.4-opa10.10*はOmni-Pathバンドル版のOpenMPIです。
Apache Hadoop
2.8.0 hadoop/2.8.0
大規模データの分散処理ミドルウェア  
openjdk
1.8.0.242 openjdk/1.8.0.242
Java開発環境  
PETSc
3.7.6　real petsc/3.7.6/real
3.7.6 complex petsc/3.7.6/complex
3.9.3 real petsc/3.9.3/real
3.9.3 complex petsc/3.9.3/complex
3.14.5 real petsc/3.14.5/real
3.14.5 complex petsc/3.14.5/complex
科学技術計算向けライブラリ群  
fftw
2.1.5 fftw/2.1.5
3.3.6 fftw/3.3.6
3.3.8 fftw/3.3.8
3.3.9 fftw/3.3.9
3.3.10 fftw/3.3.10
離散フーリエ変換 (DFT) ライブラリ  
Performance API (PAPI) ライブラリ
5.5.1 papi/5.5.1
CPUやGPUのHardware counter解析用APIライブラリ  
python
3.6.5 python/3.6.5
3.8.3 python/3.8.3
3.9.2 python/3.9.2
3.10.2 python/3.10.2
python開発環境  
gcc
8.3.0

gcc/8.3.0

gcc/8.3.0-cuda
10.1.0

gcc/10.1.0

gcc/10.1.0-cuda
10.2.0

gcc/10.2.0

gcc/10.2.0-cuda
11.2.0

gcc/11.2.0

gcc/11.2.0-cuda
GNU Compiler Collection  
vim
8.1 vim/8.1
テキストエディタ  
emacs
28.2 emacs/28.2
テキストエディタ  
ninja
1.10.0 ninja/1.10.0
ビルドツール  
HDF5
1.10.1 hdf5/1.10.1
1.10.5 hdf5-parallel/1.10.5
1.12.0 hdf5-parallel/1.12.0
I/Oライブラリ  
NetCDF
4.7.0 netcdf-parallel/4.7.0
4.7.4 netcdf-parallel/4.7.4
I/Oライブラリ  
数値解析/可視化ソフトウェア、ツール
ParaView
5.0.1 paraview/5.0.1
5.4.0 paraview/5.4.0
5.8.0

paraview/5.8.0

paraview/5.8.0-egl
5.9.0

paraview/5.9.0

paraview/5.9.0-egl
5.10.0

paraview/5.10.0

paraview/5.10.0-egl
大規模データ分析、可視化アプリケーション 並列版ParaView
POV-Ray
3.7.0.3 pov-ray/3.7.0.3
可視化アプリケーション  
VisIt
2.12.3 visit/2.12.3
大規模データ分析、可視化アプリケーション  
R
3.4.1 r/3.4.1
統計解析システム  
GIMP
2.8.22 gimp/2.8.22
2.10.4 gimp/2.10.4
画像処理ソフト（ペイントソフト）  
gnuplot
5.0.6 gnuplot/5.0.6
5.2.4 gnuplot/5.2.4
5.4.1 gnuplot/5.4.1
5.4.3 gnuplot/5.4.3
グラフ作成ソフト  
tgif
4.2.5 tgif/4.2.5
2次元の描画ソフト  
ImageMagick
7.0.6 imagemagick/7.0.6
7.0.11-1 imagemagick/7.0.11-1
画像表示と画像処理ソフト  
vmd
1.9.3 vmd/1.9.3
MD用可視化ソフト  
turbovnc
2.2.2 turbovnc/2.2.2
VNCサーバソフト  
VirtualGL
2.6.2 turbovnc/2.2.2
リモートレンダリングソフト  
ffmpeg
4.2.2 ffmpeg/4.2.2
オーディオ・ビデオコンバーター  
シミュレーション ソフトウェア
GAMESS
apr202017r1 gamess/apr202017r1
分子軌道法プログラム  
CP2K
4.1 cp2k/4.1
4.1-libint cp2k/4.1-libint
5.1_cuda cp2k/5.1_cuda
5.1-libint cp2k/5.1-libint
7.1.0 cp2k/7.1.0
8.1.0 cp2k/8.1.0
9.1.0 cp2k/9.1.0
電子状態計算プログラム  
QUANTUM ESPRESSO
6.8 quantumespresso/6.8
分子動力学プログラム  
DeePMD-kit
2.1.5 deepmd-kit/2.1.5
分子動力学プログラム+機械学習  
GROMACS
4.6.7 gromacs/4.6.7
2016.3 gromacs/2016.3
2018.1 gromacs/2018.1
2019.4 gromacs/2019.4
2020.2 gromacs-deepmd/2020.2
2020.4 gromacs/2020.4
2021.3 gromacs/2021.3
2022 gromacs/2022
分子動力学プログラム

gromacs/2019.4, gromacs/2020.4はPLUMEDがenable

gromacs-deepmd/2020.2はDeepMD-kitがenable
LAMMPS
31mar2017 lammps/31mar2017
3mar2020 lammps/3mar2020
9Oct2020 lammps/9oct2020
10feb2021 lammps/10feb2021
29sep2021_u2 lammps/29sep2021_u2
23jun2022_u1 lammps/23jun2022_u1
23jun2022_u2 lammps/23jun2022_u2
分子動力学プログラム lammps/23jun2022_u2はDeePMD-kitと連携可能
NAMD
2.12 namd/2.12
2.12-20180711 namd/2.12-20180711
2.13 namd/2.13
2.13-20191210 namd/2.13-20191210
2.14b1 namd/2.14b1
2.14b2 namd/2.14b2
2.14 namd/2.14
2.15alpha1 namd/2.15alpha1
20220414 namd/20220414
分子動力学プログラム  
Tinker
8.1.2 tinker/8.1.2
8.7.2 tinker/8.7.2
8.8.3 tinker/8.8.3
分子動力学プログラム  
OpenFOAM
4.1 openfoam/4.1
6.0 openfoam/6.0
7.0 openfoam/7.0
8.0 openfoam/8.0
9.0 openfoam/9.0
流体/連続体シミュレーション  
ESI OpenFOAM
v1906 openfoam-esi/v1906
v1912 openfoam-esi/v1912
v2012 openfoam-esi/v2012
v2112 openfoam-esi/v2112
流体/連続体シミュレーション  
linux container
Singularity
3.6.3 singularity/3.6.3
3.6.4 singularity/3.6.4
3.7.1 singularity/3.7.1
3.8.6 singularity/3.8.6
linux container for HPC