Windowsでは以下に挙げるSSHクライアントをTSUBAMEへの接続に用いることができます。
X11サーバおよびその他のLinux機能の必要性にもよりますが、上に書いてあるものほど導入コストが低くおすすめです。
OpenSSH クライアント (Windows 10の機能)
Windows 10 の [設定]-[アプリ]-[オプション機能の管理] から [OpenSSH クライアント] をインストールできます。
インストール後はコマンドプロンプトからLinuxと同様の ssh, ssh-keygen 等のコマンドが利用可能です。
PuTTY
フリーのSSHクライアントソフトウェアです。
X11サーバは含まれていないため、X11アプリケーションを利用する際には別途X11サーバをインストールする必要があります。
SSH鍵の作成方法についてはこちらのFAQ記事をご参照ください。
MobaXterm
SSHクライアントとX11サーバを内包したソフトウェアです。
TSUBAME上のX11アプリケーションのほとんどが問題なく動作するようです。
SSH鍵の作成は、PuTTYと同様ですので、PuTTYのFAQ記事をご参照ください。
Window Subsystem for Linux
Windows 10 ストアでLinuxディストリビューション(Ubuntu, OpenSUSE等)をダウンロードすることで、Windows上にLinux環境を構築することができます。
X11サーバおよびその他のLinux環境も同時に構築することとなります。
Linux環境から ssh, ssh-keygen 等のコマンドが利用可能です。
Cygwin
Windows上でLinux環境を再現するソフトウェアです。
Cygwin環境から ssh, ssh-keygen 等のコマンドが利用可能です。
長らくCygwinを使っていたなどの事情がなければ、TSUBAMEへの接続は他のソフトウェアで行うことを強く推奨いたします。